Vzrok labodnega kljuna ni popolnoma razumljiv, vendar naj bi bil posledica kombinacije genetskih dejavnikov in nenormalnega razvoja ploda. Povezana je s številnimi genetskimi motnjami, vključno z Downovim sindromom, sindromom Rubinstein-Taybi in sindromom Treacher Collins.
Labodni kljun lahko povzroči številne težave, vključno s težavami s prehranjevanjem, dihanjem in govorom. To lahko privede tudi do malokluzije in deformacije obraza. Zdravljenje labodnega kljuna lahko vključuje operacijo, da se popravi oblike zgornje čeljusti in izboljša funkcijo.