Neobdelana kanalizacija: Neustrezna sanitarna infrastruktura v skupnostih, ki obkrožajo jezero Victoria, povzroči surovo ali delno obdelano kanalizacijo, ki vstopajo v vode jezera.
Kmetijski odtok: Prekomerna uporaba gnojil in pesticidov v bližnjih kmetijskih dejavnostih predstavlja grožnjo kakovosti vode jezera. Odtok v jezero pripelje onesnaževala, vključno z nitrati, fosfati in pesticidi, kar vodi do evtrofikacije in škodljivih cvetov alg.
Urban odtok: Neupravljen mestni odtok, ki nosi smeti, kemikalije in onesnaževala, se med padavinskimi dogodki znajde v jezeru, kar še dodatno ogroža kakovost vode.
Industrijski izpusti: Industrije, ki se nahajajo okoli jezera, sproščajo odpadno vodo, ki vsebujejo potencialno škodljive kemikalije in težke kovine v jezero.
Ribiške prakse: Nezakonite ribolovne prakse prispevajo k upadu kakovosti vode z motenjem habitatov in motenjem ekološkega ravnovesja jezera.
Voda jezera Victoria je lahko varna za pitje s pravilnimi postopki zdravljenja, kot so filtracija, dezinfekcija in čiščenje. Velja voda pred uživanjem je tudi pogosta metoda za varno pitje na območjih okoli jezera. Skupnosti in institucije, ki si prizadevajo za ozaveščanje in reševanje teh vprašanj kakovosti vode, igrajo ključno vlogo pri izboljšanju kakovosti in zdravja jezera.