1. jajce :Muhe začnejo svoj življenjski cikel kot drobna, bela ovalna jajca. Ta jajca običajno položijo v grozde ali mase samice muh na različnih površinah, kot so hrana, tla, smeti ali vlažna organska snov. Jajca so neverjetno majhna in so lahko komaj vidna golemu očesu. Znotraj jajc poteka embrionalni razvoj, jajca pa se začnejo razvijati v črve.
2. LARVA (maggot) :Po izvalitvi iz jajc muhe vstopijo v fazo ličink, ki jih običajno imenujemo maggoti. Maggoti so običajno majhna, črvična bitja z segmentiranim telesom in brez vidne glave ali nog. Običajno jih najdemo v razpadajoči organski snovi, kjer se aktivno hranijo in rastejo. Maggoti imajo ust ali specializirane uprave, ki jim omogočajo, da se razgradijo in porabijo propadajoče organske materiale, kot so gnilo sadje, zelenjava ali živalska trupla. V fazi ličinke gredo skozi več strežnikov in odvrnejo svojo zunanjo kožo, ko postanejo večji.
3. pupa (kokon) :Ko črvi dosežejo določeno velikost in dokončajo svoj ličinka, vstopijo v fazo puha. V tej fazi so se magni znatno preoblikovali znotraj trde, zaščitne zunanje lupine ali kokona. Pupe so nepremične in običajno pritrjene na površino. Znotraj kokona se telo maggotov doživi dramatično spremembo in razvija strukture za odrasle muhe, kot so krila, noge, antene in sestavljene oči.
4. Fly :Ko je preobrazba končana, odrasle muhe izhajajo iz mladičev. Na novo nastale muhe so mehke in blede barve, vendar se njihova telesa hitro strdijo in zatemnijo. Odrasle muhe so popolnoma razvile krila, kar jim omogoča, da leteti in prosto premikajo. Imajo prebadanje ali gobice iz ust, odvisno od vrste, in se lahko hranijo s široko paleto virov hrane, kot so nektar, cvetni prah, gnilo organsko snov ali kri (v primeru nekaterih vrst). Muhe za odrasle sodelujejo predvsem pri razmnoževanju, iskanju primernih prijateljev in iskanju hrane. Odrasle muhe odlagajo jajca in življenjski cikel se ponavlja.
Trajanje vsake stopnje in celoten življenjski cikel muhe se lahko razlikujeta glede na vrsto in okoljske razmere, kot sta temperatura in vlažnost. Na splošno se lahko čas od jajca do odraslega od nekaj dni do nekaj tednov.