1. bakterije:
Primeri:
- Escherichia coli (E. coli)
- Staphylococcus aureus
- Streptococcus pneumoniae
- salmonela
- Bacillus subtilis
- Lactobacillus
2. virusi:
Primeri:
- Virus gripe
- virus ošpic
- MUMPS virus
- Rubella virus
- virus herpes simpleksa
- HIV (virus človeške imunske pomanjkljivosti)
3. Glive:
Primeri:
- Candida albicans
- Aspergillus fumigatus
- Cryptococcus neoformans
- Tinea Corporis (Ringworm)
- Sporothrix Schenckii
4. zajedavci:
Primeri:
- Plasmodium falciparum (parazit malarije)
- Entamoeba histolytica (amoeba)
- Toxoplasma gondii
- schistosoma mansoni (krvni fluke)
- Giardia Lamblia
5. Protozoa:
Primeri:
- Paramecium
- Ameba Proteus
- Euglena
- Trypanosoma brucei (afriška spalna bolezen)
- Plasmodium vivax
Omeniti velja, da znotraj teh skupin obstajajo številne vrste in sevi mikrobov, vsaka z edinstvenimi lastnostmi in vedenjem. Tu je naveden seznam le majhen izbor velikega mikrobnega sveta.