Smrtnost jajčnih in piščancev: Tanjšanje morskega ledu tudi poveča tveganje za smrtnost jajčnih in piščancev z drobljenjem ali utopitvijo.
Izčrpavanje plena: Podnebne spremembe vplivajo na obilje drobnega krila v obliki kozic, ključnega vira hrane za cesarske pingvine in njihov plen, kar zmanjšuje njihovo razpoložljivost za pingvine.
ribolov in druge človeške dejavnosti: Ljudje lahko motijo pingvinske kolonije z ribolovom, turizmom in znanstvenimi raziskavami, zlasti v občutljivih obdobjih vzreje in gnezdenja.
Plastično onesnaževanje :Cesarski pingvini lahko med iskanjem hrane zaužijejo plastične odpadke v oceanu, kar vodi v zdravstvene težave in zmanjša preživetje.
Izbruhi bolezni in parazita: Podnebne spremembe lahko spremenijo dinamiko ekosistema in izpostavijo cesarske pingvine novim boleznim ali parazitom, ki jih niso prilagojeni, kar vodi v upadanje prebivalstva.
Konkurenca drugih vrst :Z izgubo morskega ledu in spreminjajočimi se ekosistemi se lahko cesarski pingvini soočajo z večjo konkurenco za hrano in plemensko območje drugih vrst, kar še okrepi grožnje, s katerimi se srečujejo.