Lov: Jaguarje lovijo tudi zaradi njihovega krzna in drugih delov telesa. Njihove zobe in kremplje pogosto prodajajo kot spominke, njihovo meso pa včasih zaužijejo. Na nekaterih območjih jaguarje lovijo tudi zaradi športa.
Konflikt z ljudmi: Jaguarji lahko včasih pridejo v konflikt z ljudmi, zlasti ko plenijo živino. To lahko povzroči, da rančerji in kmetje v maščevanje ubijajo jaguarje.
Podnebne spremembe: Podnebne spremembe negativno vplivajo tudi na jaguarje. S segrevanjem podnebja postajajo habitati jaguarjev toplejši in bolj suhi, zaradi česar je težje preživeti.
Zaradi teh groženj so jaguarji zdaj razvrščeni kot "skoraj ogroženi" s strani Mednarodne zveze za ohranjanje narave (IUCN). To pomeni, da jim grozi, da bodo v bližnji prihodnosti izumrli, če prizadevanja za ohranitev ne bodo okrepljena.