Glavni razlogi za ogroženi status sesalca Rio Grande so:
Izguba in degradacija habitata :To je najpomembnejša grožnja sesanju Rio Grande. Njihov naravni habitat je sestavljen iz plitvih, čistih, toplih potokov z gramoznimi in kabinskimi dnami ter veliko vodne vegetacije. Spremembe in uničenje teh habitatov zaradi človeških dejavnosti, kot so preusmeritev vode, gradnja jezov, kanalizacija in urbanizacija, so privedle do znatnega zmanjšanja domenja in prebivalstva sesanja.
onesnaževanje :Uvedba onesnaževal, vključno s kmetijskimi odtoki, kanalizacijo, industrijskimi onesnaževalci in kemikalijami v Rio Grande, je še poslabšala kakovost vode in negativno vplivala na habitat sesalca. Onesnažena voda lahko vpliva na zdravje, razmnoževanje in hranjenje sesanja.
Overfing :V preteklosti je bil sesalec Rio Grande ujet kot vir hrane in jih je ribolov uporabljal kot vabo. Nevzdržne ribolovne prakse so prispevale k upadu vrste, zlasti v obdobjih, ko je bilo njihovo prebivalstvo že ranljivo zaradi izgube habitata in degradacije.
Plening :Uvedene tujerodne vrste, kot sta Rdeči Shiner in Largemouth Bass, so se postavile v Rio Grande in Plen na sesalcu Rio Grande in dodale nadaljnji pritisk na že zmanjšano populacijo.
Tekmovanje :Konkurenca za hrano in habitat drugih domačih in tujih ribjih vrst prav tako predstavljajo izzive za preživetje sesalca Rio Grande.
Za ublažitev teh groženj in zaščiti preostalega prebivalstva sesanja Rio Grande so bila izvedena prizadevanja za ohranjanje, kot so projekti obnove habitata, načrti za upravljanje voda in predpisi o umiku vode in onesnaženosti. Vendar so ta prizadevanja ključnega pomena za dolgoročno preživetje in okrevanje te ogrožene vrste za učinkovito reševanje teh stalnih groženj.