Glavni vzrok za ogroženost volnate pajkaste opice je izguba življenjskega prostora. Habitat volnate pajkaste opice se čisti za različne namene, vključno s sečnjo, kmetijstvom in naseljevanjem ljudi. Zaradi tega dlakava pajkasta opica izgubi svoj življenjski prostor ter sposobnost iskanja hrane in zatočišča.
Lov in krivolov
Volnate pajkaste opice lovijo tudi zaradi mesa in krzna. To je velika grožnja za njihovo preživetje, saj zmanjšuje velikost populacije in preprečuje razmnoževanje vrste.
Podnebne spremembe
Podnebne spremembe ogrožajo tudi volnato pajkasto opico. Ker se podnebje spreminja, postaja življenjski prostor volnate pajkaste opice vse manj primeren za njeno preživetje. To povzroča, da se volnata pajkasta opica seli na nova območja, kjer morda ni tako dobro prilagojena in kjer se lahko sooči z novimi grožnjami.