1. konvergentna evolucija :Konvergentna evolucija se pojavi, kadar nepovezane vrste razvijajo podobne lastnosti neodvisno, pogosto kot odgovor na podobne okoljske pritiske. Na primer, racionalizirana telesna oblika delfinov in rib se je v obeh skupinah razvijala neodvisno kot prilagoditev za učinkovito gibanje v vodi. Kljub podobnemu videzu so delfini sesalci, medtem ko so ribe vretenčarji in spadajo v različne evolucijske linije.
2. Skupne lastnosti prednikov :Nekatere vrste si lahko delijo določene lastnosti zaradi skupnega prednika, čeprav so se pozneje razhajale in pridobile različne značilnosti. Na primer, netopirji in ptice imajo krila, netopirji pa so sesalci, medtem ko so ptice plazilci. Prisotnost kril v obeh skupinah kaže na skupno evolucijsko zgodovino.
3. Molekularni dokazi :Genetska analiza, kot je sekvenciranje DNK, lahko razkrije resnična evolucijska razmerja med vrstami. S primerjanjem sekvenc DNK lahko znanstveniki določijo stopnjo genetske podobnosti med različnimi vrstami in sklepajo o njihovih evolucijskih odnosih. Dokazi DNK lahko odkrijejo tesne genetske odnose tudi med vrstami, ki so morfološko videti zelo različne.
4. Prilagodljivo sevanje :Prilagodljivo sevanje se pojavi, ko ena vrsta prednikov povzroči vrsto različnih vrst z izrazito morfologijo in prilagoditvami. Primer so Darwinovi plavuti na otokih Galapagos, kjer so različne vrste finč razvijale različne oblike kljuna za izkoriščanje specifičnih virov hrane. Kljub njihovim spremembam v strukturi kljuna imajo ti plavuti skupnega prednika in so tesno povezane.
Zato je možno, da sta dve vrsti, ki sta med seboj zelo različni, bolj povezani kot podobni drugim vrstam zaradi dejavnikov, kot so konvergentna evolucija, lastnosti deljenih prednikov, molekularni dokazi in prilagodljivo sevanje.