1. DDT zastrupitev: Široka uporaba pesticida DDT (diklorodifeniltrikloroetan) je imela uničujoč vpliv na populacijo plešastih orlov. DDT se je nabral v okolju in vstopil v prehransko verigo, pri čemer je dosegel visoke koncentracije pri plenilskih pticah, kot so orli. DDT moti metabolizem kalcija, kar vodi do redčenja jajčnih lupin in reproduktivne odpovedi pri orlih. Posledično so populacije plešastih orlov doživele močan upad svojih reproduktivnih stopenj in ugnezditvenega uspeha.
2. Izguba in uničenje habitata: Uničenje in razdrobljenost plešastih orlovskih habitatov sta igrala pomembno vlogo pri upadu njihove populacije. Hitri razvoj mest, krčenje gozdov in industrijske dejavnosti, ki so posegale na njihova gnezdenja, lovišča in območja, ki se nahajajo. Izguba ustreznih habitatov je zmanjšala nosilnost okolja in plešasti orli izziv, da najdejo ustrezne vire za preživetje in uspevanje.
3. Lov in preganjanje: Plešasti orli so bili podvrženi tudi lovu in preganjanju, kar je prispevalo k upadu njihovega prebivalstva. Zgodovinsko gledano so jih ubili za šport, lov na trofeje ali kot zaznane grožnje živini ali ribištvu. Prepričanje, da so orli plenili živino in druge ekonomsko pomembne vrste, je privedlo do njihovega preganjanja in namernega odstranjevanja.
4. Zbiranje in motnje jajc: Plešasta orel gnezda so bila pogosto usmerjena z zbiralci jajc, kar je še bolj zmanjšalo njihov reproduktivni uspeh. Praksa zbiranja orlovskih jajc za znanstvene ali okrasne namene je motila poskuse gnezdenja in ogrozila preživetje svojih mladih.
5. Sekundarna zastrupitev: Na plešaste orle lahko vplivajo tudi sekundarna zastrupitev zaradi uživanja vrst plena, ki so nabrale strupene snovi, na primer svinca iz svinčenih ribolovnih potopic ali živega srebra iz industrijskih onesnaževal.
Kombinacija teh dejavnikov je populacijo plešastega orla pripeljala na rob izumrtja. Vendar pa se je populacija plešastih orlov zahvaljujoč prizadevanjem za ohranjanje, vključno z prepovedjo DDT, izvajanjem zaščitnih zakonov in predpisov, kampanji za ozaveščanje javnosti in projektom obnove habitatov, izjemno okrevala in se ne šteje več za ogroženo.