DDT, obstojni organoklorni insekticid, se prek prehranjevalne verige kopiči v tkivih beloglavega orla in drugih ujed. Ko so ptice zaužile kontaminiran plen, se je DDT koncentriral v njihovih telesih, kar je nazadnje vplivalo na njihov reproduktivni uspeh. Eden najpomembnejših vplivov DDT na plešaste orle je bilo tanjšanje jajčnih lupin. To se je zgodilo, ker je DDT motil presnovo kalcija, ključnega minerala za tvorbo jajčnih lupin. Posledično so lupine postale tanjše in bolj dovzetne za zlom med inkubacijo, kar je povzročilo zmanjšan uspeh izvalitve in upad populacije.
Zmanjšana imunska funkcija: DDT je vplival tudi na imunski sistem plešastih orlov, zaradi česar so bili bolj dovzetni za bolezni in okužbe. To je dodatno prispevalo k zmanjšanju njihove populacije.
Motnje v regulaciji hormonov: DDT lahko posnema učinke estrogena, ženskega spolnega hormona. To lahko poruši normalno hormonsko ravnovesje pri samcih in samicah beloglavega orla, kar vodi do reproduktivnih težav, nenormalnega razvoja in vedenjskih sprememb.
Kopičenje DDT pri odraslih beloglavih orlih je imelo daljnosežne posledice, ne le za reproduktivni uspeh in preživetje vrste, ampak tudi za celoten ekosistem. Prepoved DDT in posledično zmanjšanje njegove uporabe v mnogih državah je igralo ključno vlogo pri obnovitvi populacije beloglavega orla.