Oteklina: Eden najbolj značilnih simptomov miksomatoze je oteklina, zlasti okoli glave in obraza, pa tudi veke in ušesa. To otekanje povzroča edem (kopičenje tekočine) in ga lahko spremljajo jok z oči in nosu.
Lezije: Okuženi zajci lahko razvijejo kožne lezije ali nodule, ki se lahko pojavijo na obrazu, ušesih in drugih območjih telesa. Te lezije se lahko gibljejo po velikosti in videzu, od majhnih, dvignjenih udarcev do večjih, razjedenih območij.
Težave z respiranjem: Miksomatoza lahko vpliva tudi na dihalni sistem, kar povzroči simptome, kot so kašelj, kihanje in izcedek iz nosa. V hudih primerih lahko okužba privede do pljučnice in težko dihanja.
Očesne težave: Oteklina in izcedek iz oči sta lahko pomemben problem pri zajcih z miksomatozo, v nekaterih primerih pa lahko okužba privede do konjunktivitisa ali celo motnosti roženice.
Vročina in letargija: Okuženi zajci lahko doživijo vročino in letargijo, kar ima za posledico zmanjšanje aktivnosti in apetita.
Smrt: Miksomatoza je pogosto smrtna, stopnja umrljivosti pa je lahko precej visoka, zlasti pri populacijah divjih zajcev. Napredek bolezni je lahko hiter, prizadeti zajci pa lahko podležejo v nekaj dneh ali tednih.