Belouho žepno miško ogrožajo invazivne vrste, kot sta rdeča uvožena ognjena mravlja in divji prašič. Ognjene mravlje lahko žepne miši ubijejo ali poškodujejo neposredno tako, da jih napadejo in zastrupijo. Prav tako lahko zaužijejo semena in žuželke, ki jih žepne miši potrebujejo za hrano. Divji prašiči lahko tekmujejo z žepnimi mišmi za hrano in zatočišče ter uničijo njihov življenjski prostor s kopanjem in valjanjem.
Izguba habitata
Belouha žepna miška izgublja svoj življenjski prostor zaradi več dejavnikov, vključno z razvojem mest, kmetijstvom in rudarstvom. Ko človeška populacija raste in razvija nova območja, se habitat, ki je na voljo za belouhe žepne miši, zmanjšuje. Kmetijstvo lahko tudi spremeni travnike in druge habitate, pomembne za žepne miši, v obdelovalne površine ali pašnike. Rudarjenje lahko tudi poškoduje ali uniči življenjski prostor žepne miške z ustvarjanjem jam, cest in druge infrastrukture.
Podnebne spremembe
Podnebne spremembe in z njimi povezani spreminjajoči se vremenski vzorci močno vplivajo na življenjski prostor in preživetje belouhe žepne miši. Spreminjajoči se vremenski vzorci so zmotili mišje reprodukcijske cikle, kar je povzročilo upad populacije. Naraščajoče temperature in ekstremni vremenski dogodki, kot so suše in neurja, povzročajo tudi izgubo vitalnega življenjskega prostora in virov hrane za belouho žepno miško.
Bolezen
Bolezni, kot sta hantavirus in kuga, dodatno ogrožajo belouho žepno miško. Te bolezni nosijo glodalci in se lahko razširijo na žepne miši, kar povzroči upad populacije. Širjenje bolezni olajšuje razdrobljenost habitatov, zaradi česar so različne vrste glodalcev v tesnejšem stiku in povečuje prenos teh smrtonosnih patogenov.
Prekomerna paša živine
Prekomerna paša živine lahko bistveno spremeni vegetacijsko sestavo in strukturo travišč, primarnega življenjskega prostora belouhe žepne miši. Ta degradacija zmanjša razpoložljivost hrane in pokrova za miško, zaradi česar je bolj ranljiva za plenilce in vpliva na njen reproduktivni uspeh.
Ti dejavniki, skupaj z omejenim geografskim območjem belouhe žepne miši in nizko gostoto populacije, so privedli do njene uvrstitve med ogrožene vrste. Naravovarstvena prizadevanja za zaščito in obnovo njenega življenjskega prostora, obvladovanje invazivnih vrst, blažitev posledic podnebnih sprememb in preprečevanje širjenja bolezni so bistvenega pomena za zagotavljanje preživetja belouhe žepne miši.