Izguba in razdrobljenost habitata: Jaguarji potrebujejo ogromne, nedotaknjene habitate, da preživijo in uspevajo. Na žalost se zaradi kmetijstva, sečnje, rudarjenja in človeških naselij pojavita pomembna izguba habitata in razdrobljenost. Krčenje gozdov in razdrobljenost deževnih gozdov, kjer živijo Jaguarji, zmanjšujejo razpoložljivi plen, motijo gibanje in povečujejo verjetnost konflikta z ljudmi.
Human-Wildlife konflikt: Ko se človeške dejavnosti širijo, Jaguarji pogosto prihajajo v konflikt s kmetje in rančarji. Jaguarji so krivi za odstranjevanje živine, kar vodi do povračilnih pobojev. Ta konflikt je pomembna grožnja, zlasti za jaguarje, ki živijo v bližini pokrajin, kjer prevladujejo ljudje.
Nevzdržne lovske prakse: Na nekaterih območjih se jaguarji lovijo zaradi preživljanja ali športnega lova. To lahko škoduje lokalnemu populaciji Jaguar, če lovske predpise ne bodo pravilno upravljani in uveljavljeni.
Premalo organov pregona in zaščita: Kljub mednarodnim zakonom o ohranjanju je lahko uveljavljanje teh predpisov in ustrezno zaščito jagurskega prebivalstva izziv. Nezadostni viri za zaščito prostoživečih živali in korupcijo ovirajo prizadevanja za boj proti preganjanju in nezakonitih dejavnostih.
Pomembno je opozoriti, da je za reševanje teh groženj potrebno sodelovanje med vladami, ohranitvenimi organizacijami, lokalnimi skupnostmi in avtohtonimi ljudstvi. S spodbujanjem ohranjanja habitatov, uravnavanjem lova, podpiranjem prizadevanj za preprečevanje in ozaveščanjem o ohranitvi Jaguarja lahko pomagamo zaščititi te veličastne živali in zagotoviti njihovo dolgoročno preživetje v naravi.