2. Sprememba in izguba habitata: Estuariji so vitalni habitati za različne morske in kopenske vrste v različnih življenjskih obdobjih. Človekove dejavnosti, kot so melioracija zemljišč, poglabljanje dna, gradnja pristanišč in marin ter urbani razvoj, so povzročile obsežne spremembe in izgubo habitata. Poleg tega lahko spremembe v dotokih sladke vode zaradi jezov in preusmeritev vode pomembno vplivajo na ekološko ravnovesje estuarijev.
3. Prelov in izkoriščanje: Estuariji podpirajo bogate populacije rib zaradi svojih bogatih virov hrane in služijo kot kritična gnezdišča za številne vrste. Netrajnostne ribolovne prakse in prekomerno izkoriščanje sta povzročila izčrpavanje ribjih staležev, kar ogroža ekološko ravnovesje in gospodarsko vrednost teh območij.
4. Pridobivanje naravnih virov: Estuariji pogosto vsebujejo dragocene naravne vire, kot so pesek, gramoz in nafta. Pridobivanje teh virov lahko neposredno moti fizično strukturo estuarija, spremeni vzorce vodnega toka in povzroči degradacijo habitata.
5. Vplivi podnebnih sprememb: Estuariji so zelo občutljivi na vplive podnebnih sprememb, vključno z dvigovanjem morske gladine, zakisanostjo oceanov, spremembami gradientov slanosti in spremenjenimi vzorci padavin. Te spremembe lahko povzročijo izgubo habitata, motnje v porazdelitvi vrst in splošno destabilizacijo ekosistema.
Krhkost estuarijev izhaja iz kombinacije njihovih kritičnih ekoloških funkcij, občutljivosti na onesnaženje in spreminjanje habitata, ranljivosti njihovih prebivalcev in izzivov, ki jih prinašajo podnebne spremembe. Za zaščito teh neprecenljivih ekosistemov so izjemnega pomena celovite strategije upravljanja, prizadevanja za ohranitev in trajnostne prakse.