Fitoplankton: Cvetenje alg pogosto vključuje hitro rast nekaterih vrst fitoplanktona, ki so mikroskopske alge, ki tvorijo osnovo prehranjevalne verige v vodnem okolju. Medtem ko so nekateri fitoplanktoni koristni kot vir hrane za zooplankton, lahko prekomerna rast povzroči neravnovesje v ekosistemu.
Zooplankton: Zooplankton so majhne živali, ki se prehranjujejo s fitoplanktonom. Med cvetenjem alg lahko nenadno povečanje številčnosti fitoplanktona povzroči hitro povečanje populacij zooplanktona. Ker pa cvetenje alg upada, se lahko zooplankton sooči s pomanjkanjem hrane, kar vodi do zmanjšanja populacije in zmanjšane razpoložljivosti hrane za višje trofične ravni.
Ribe: Ribe se zanašajo na zooplankton kot primarni vir hrane. Ko se populacije zooplanktona zmanjšajo zaradi posledic cvetenja alg, se lahko ribe soočijo z zmanjšano razpoložljivostjo hrane. To lahko vpliva na njihovo rast, razmnoževanje in splošno zdravje, kar vodi do potencialnega zmanjšanja populacije rib.
Bentoški organizmi: Bentoški organizmi živijo na dnu ribnika ali blizu njega. Cvetenje alg lahko ustvari gosto preprogo na vodni površini, ki prepreči sončni svetlobi, da bi dosegla bentoško območje. Ta zmanjšana razpoložljivost svetlobe lahko negativno vpliva na fotosintezo in rast bentoških rastlin, ki služijo kot hrana in življenjski prostor za različne organizme.
Pomanjkanje raztopljenega kisika: Med cvetenjem alg pretirana rast alg med fotosintezo porabi veliko količino kisika. Ko alge odmrejo in se razgradijo, sprostijo organske snovi v vodo, kar dodatno poveča porabo kisika s strani razkrojevalcev. Ta proces lahko povzroči pomanjkanje kisika in ustvarja hipoksične pogoje, ki povzročajo stres ali uničenje vodnih organizmov.
Nihanja pH in ogljikovega dioksida: Cvetenje alg lahko spremeni pH in ravni ogljikovega dioksida v vodi. Čez dan lahko intenzivna fotosinteza alg poveča pH in zmanjša raven ogljikovega dioksida. Nasprotno pa ponoči, ko se fotosinteza ustavi, alge dihajo in sproščajo ogljikov dioksid, kar zniža pH in poveča raven ogljikovega dioksida. Ta nihanja lahko motijo dihalne in presnovne procese drugih vodnih organizmov.
Toksini in alelopatija: Nekateri cvetovi alg vključujejo rast škodljivih vrst alg, ki proizvajajo toksine. Ti toksini se lahko kopičijo v vodi in vplivajo na različne organizme, vključno z ribami, zooplanktonom in drugimi vodnimi organizmi. Poleg tega lahko nekatere alge sproščajo alelopatske snovi, ki zavirajo rast ali preživetje drugih organizmov, kar dodatno moti ekosistem.
Na splošno lahko cvetenje alg poruši občutljivo ravnovesje ekosistemov ribnikov, tako da spremeni prehranjevalne mreže, povzroči pomanjkanje kisika, vnese toksine in vpliva na splošno zdravje in preživetje različnih vodnih organizmov.