1. Zapletenost vzorca :Tekočinska kromatografija je na splošno manj učinkovita za ločevanje kompleksnih vzorcev z velikim številom komponent. To je zato, ker več komponent je prisotnih v vzorcu, težje je doseči dobro ločevanje in ločljivost.
2. Vzorci matričnih učinkov :Matrica vzorca lahko tudi moti kromatografsko ločevanje. Na primer, če vzorec vsebuje visoke ravni soli ali drugih nehlapnih spojin, lahko te tekmujejo z analiti za vezavo na stacionarno fazo, kar povzroči slabo ločevanje.
3. Preobremenitev stolpca :Če se v kolono vbrizga preveč vzorca, lahko preobremeni stacionarno fazo in povzroči slabo ločitev. To je zato, ker bodo vzorčne molekule tekmovale za vezavna mesta na stacionarni fazi, kar vodi do razširitve vrhov in zmanjšane ločljivosti.
4. Sestava mobilne faze :Na učinkovitost tekočinske kromatografije lahko vpliva tudi sestava mobilne faze. Na primer, če je mobilna faza preveč polarna, lahko povzroči slabo zadrževanje analitov na stacionarni fazi, medtem ko lahko, če je mobilna faza preveč nepolarna, povzroči slabo ločevanje analitov.
5. Temperatura :Temperatura lahko vpliva tudi na učinkovitost tekočinske kromatografije. Na primer, če je temperatura previsoka, lahko povzroči povečano širjenje pasu in zmanjšano ločljivost, medtem ko lahko prenizka temperatura povzroči slabo obliko vrha in zmanjšano občutljivost.
6. Instrumentacija :Kakovost instrumentov, ki se uporabljajo za tekočinsko kromatografijo, lahko prav tako vpliva na njeno učinkovitost. Na primer, če črpalka ne more zagotavljati doslednega pretoka, lahko povzroči slabo ločevanje in zmanjšano ponovljivost. Podobno, če detektor ni dovolj občutljiv, morda ne bo mogel zaznati nizkih ravni analitov.
Z razumevanjem in obravnavanjem teh potencialnih omejitev je mogoče optimizirati tehnike tekočinske kromatografije za največjo učinkovitost.