Glavni razlog, zakaj inkubator potrebuje vodo, je vzdrževanje vlažnosti. Vlažnost je pomembna iz več razlogov, vključno z:
* Da bi se jajca izsušila. Jajca so sestavljena iz približno 70% vode in bodo izgubila vlago, če je vlažnost prenizka. To lahko povzroči, da se zarodek dehidrira in umre.
* Za olajšanje izmenjave plina. Kisik in ogljikov dioksid se morata prosto premikati po lupini, da bo zarodek dihal. Visoka vlažnost pomaga ustvariti vlažno okolje, ki omogoča enostavno izmenjavo plina.
* Za pomoč pri uravnavanju temperature. Voda ima visoko specifično toplotno zmogljivost, kar pomeni, da je za spremembo temperature potrebna veliko energije. To pomaga ohranjati stabilno temperaturo inkubatorja, tudi če sobna temperatura niha.
Večina inkubatorjev ima rezervoar za vodo, ki se nahaja na dnu enote. Ko voda izhlapi, ustvarja vlažno okolje znotraj inkubatorja. Stopnjo vlažnosti je mogoče nadzorovati s prilagoditvijo količine vode v rezervoarju. Nekateri inkubatorji imajo tudi ventilator, ki pomaga krožiti zrak in enakomerno porazdelitev vlažnosti.