Tukaj je razlog:
* Genetika: Modre oči pri konjih so posledica recesivnega gena. To pomeni, da mora konj podedovati dve izvodi gena, po enega od vsakega starša, da ima modre oči.
* Združenje barv plašča: Modre oči so pogosto povezane z določenimi barvami plašča, kot sta bela ali Cremello, kjer lahko pomanjkanje melaninskega pigmenta vpliva tudi na barvo oči. Vendar se lahko pojavijo tudi v drugih barvah, vendar manj pogosto.
* redkost: Čeprav niso neznane, so modre oči razmeroma redka lastnost pri konjih.
Pomembno je opozoriti: Včasih se lahko zdi, da imajo konji modre oči zaradi načina, kako se svetloba odseva z njihovih oči, vendar to ni resnična modra barva oči.