Pripravljalna faza: V tej začetni fazi se molekula sladkorja s 6 ogljikovimi atomi (običajno glukoza) dvakrat fosforilira, da nastane fruktoza-1,6-bisfosfat. Ta proces zahteva vnos 2 molekul ATP in uporablja encima heksokinazo in fosfofruktokinazo.
Faza cepitve: Med to stopnjo se fruktoza-1,6-bisfosfat razcepi na dva sladkorja s tremi ogljikovimi atomi:gliceraldehid-3-fosfat (GAP) in dihidroksiaceton fosfat (DHAP). Ti dve molekuli sta medsebojno konvertibilni in obe lahko napredujeta naprej po poti.
Izplačilna faza: Ta zadnja stopnja vključuje pretvorbo GAP in DHAP v piruvat, pri čemer v procesu nastaneta ATP in NADH. Ta stopnja je sestavljena iz več encimskih korakov, vključno s fosforilacijo in oksidacijskimi reakcijami na ravni substrata. Na koncu se proizvedeta 2 molekuli piruvata skupaj s skupno 4 molekulami ATP in 2 molekulama NADH za vsako molekulo glukoze, ki vstopi v glikolizo.