Eriskay Ponies so razmeroma majhna pasma in zaradi tega obstaja veliko tveganje za inbreeding. Kadar se sorodni posamezniki vzrejajo skupaj, imajo potomci zdravstvene težave in oslabljeni imunski sistemi. To je zato, ker podedujejo iste genetske napake in ranljivosti. Inbreeding prav tako zmanjšuje gensko raznolikost, zaradi česar je populacija manj odporna na okoljske spremembe in bolezni.
2. Izguba genetske raznolikosti
Poniski Eriskay so na otokih že stoletja izolirani, kar pomeni, da je bilo z drugimi populacijami ponija zelo malo genetske izmenjave. Zaradi pomanjkanja genetske raznolikosti jih je bilo ranljivo za nekatere genetske motnje in bolezni.
3. Omejen habitat
Eriskay Ponies so domači v oddaljenem in ostrem okolju zunanjih Hebridov, ki so skupina otokov ob obali Škotske. Njihov omejen habitat pomeni, da imajo omejeno oskrbo s hrano in so izpostavljeni močnim vremenskim razmeram. To prebivalstvu otežuje preživetje in uspešno razmnoževanje.
4. Konkurenca drugih vrst
Eriskay Ponies se sooča s konkurenco za vire drugih vrst, vključno z ovcami in rdečimi jeleni. Te živali lahko presežejo ponije za hrano in vodo, kar lahko privede do podhranjenosti in bolezni.
5. Lov in prekomerno pašanje
V preteklosti so Eriskay Ponies lovili za svoje meso in pelete. To je bil glavni dejavnik njihovega upada. Poleg tega je k izgubi habitata prispevala tudi prekomerna paša ovc in drugih živali.
6. Podnebne spremembe
Podnebne spremembe so še ena velika grožnja za Eriskay Ponies. Ko se podnebje segreva, otoki doživljajo bolj ekstremne vremenske razmere, kot so nevihte in poplave. Ti dogodki lahko povzročijo izgubo habitata in poniji otežijo preživetje.