Večji plenilci:
* Wolves: Volkovi so glavni plenilec kojotov, zlasti na območjih, kjer se obe vrsti prekrivata.
* medvedi: Medtem ko so manj pogosti, lahko medvedi, zlasti medvedi grizli, plenijo na kojote, še posebej, če se čistijo ali lovijo.
* Gorski levi: Gorski levi, zlasti v zahodnih Združenih državah Amerike, so sposobni ubiti kojote, čeprav je bolj verjetno, da bodo šli po večjem plenu.
Drugi plenilci:
* Bobcats: Bobcats, manjši od kojotov, lahko včasih plenijo mlade kojote ali kojote, ki so oslabljeni ali poškodovani.
* Veliki raptorji: Zlati orli in drugi veliki raptorji lahko odnesejo mlade ali manjše kojote.
* Drugi kojoti: Kojoti se lahko vključijo v kanibalizem, zlasti med ostrimi zimami ali kadar je sredstev malo.
Ljudje:
* Lov: Kojote pogosto lovijo ljudje zaradi nadzora prebivalstva in za zaščito živine.
Druge grožnje:
* Bolezni: Kojoti lahko podležejo različnim boleznim, vključno z steklino, distemirjem in zajedavci.
* vozila: Kojote pogosto zadenejo vozila, zlasti v bližini cest in avtocest.
Pomembno je opozoriti, da plenjenje kojota ni pogosto, saj so zelo prilagodljive in iznajdljive živali. Vendar imajo ti plenilci vlogo pri uravnavanju populacij kojota.