Teorija evolucije je močno vplivala na način razvrščanja vrst. Pred pojavom evolucijske teorije so bile vrste razvrščene na podlagi njihovih fizičnih podobnosti z malo upoštevanja njihovih evolucijskih odnosov. Vendar je evolucijska teorija uvedla koncept skupnega spusta, ki navaja, da so vsi živi organizmi izvirani iz skupnega prednika. To je privedlo do razvoja filogenetske klasifikacije, ki združuje vrste na podlagi njihovih evolucijskih odnosov, ne pa na njihovih fizičnih podobnostih.