* visoki stroški: Programi reje v ujetništvu so lahko drage za nastavitev in vzdrževanje. To vključuje stroške objektov, opreme, osebja in hrane.
* Pomanjkanje genetske raznolikosti: Programi za vzrejo v ujetništvu lahko privedejo do pomanjkanja genske raznolikosti, zaradi česar lahko populacijo postane bolj ranljiva za bolezni in druge grožnje.
* Povečano tveganje za bolezen: Živali v ujetništvu so pogosto bolj dovzetne za bolezni kot divje živali, saj niso izpostavljene enakim naravnim izzivom.
* Nenaravno vedenje: Živali v ujetništvu lahko kažejo nenaravno vedenje, saj ne morejo živeti v svojem naravnem okolju. To lahko privede do stresa in drugih zdravstvenih težav.
* Etični pomisleki: Nekateri verjamejo, da so programi reje v ujetništvu neetični, saj vključujejo odvzemanje živali iz svojega naravnega habitata in jih ohranjati v ujetništvu.
Na splošno so lahko programi reje v ujetništvu koristno orodje za ohranjanje ogroženih vrst, vendar imajo tudi številne pomanjkljivosti. Pomembno je, da skrbno tehtate prednosti in slabosti, preden se odločite, ali začnete ujeti program vzreje v ujetništvu ali ne.