Bobri uporabljajo označevanje z vonjem za medsebojno komunikacijo in za označevanje svojega teritorija. Imajo dišeče žleze, ki se nahajajo na njihovem repu, stopalih in zadnjici in oddajajo vonj z drgnjenjem teh predelov ob predmete. Vonj deluje kot opozorilo drugim bobrom, da je območje že zavzeto.
Zobje in kremplji
Bobri imajo močne zobe in kremplje, s katerimi se branijo pred plenilci. Njihovi zobje nenehno rastejo in lahko zrastejo do 2 cm na leto. Njihovi kremplji so ostri in zakrivljeni, zato lahko povzročijo resne poškodbe.
Klofute
Bobri so znani po močnih klofutah. Lahko udarjajo z repom ali s tacami. Bobrov udarec lahko plenilca omami ali celo pade v nezavest.
Plavanje
Bobri so odlični plavalci, po vodi pa se lahko poganjajo tudi z repom. Lahko se tudi potopijo pod vodo in ostanejo potopljeni do 15 minut. Zaradi tega jih plenilci težko ujamejo.
Burrows
Bobri živijo v rovih, ki jim nudijo zaščito pred plenilci. Njihovi rovi se običajno nahajajo na bregovih rek ali potokov in so zgrajeni z več vhodi in izhodi. Zaradi tega je plenilcem težko priti v rov.
Jezovi
Bobri gradijo jezove, da ustvarijo ribnike, ki jim zagotavljajo varno bivanje in vzgojo mladičev. Jezovi prav tako pomagajo nadzorovati pretok vode, kar lahko prepreči poplave in ustvari nov habitat za druge živali.
Druge obrambe
Poleg zgoraj naštetih obrambnih sposobnosti imajo bobri tudi številne druge prilagoditve, ki jim pomagajo preživeti v naravi. Mednje spada njihov gost kožuh, ki jim pomaga ohranjati toploto v hladnem vremenu, in njihova sposobnost shranjevanja maščobe, ki jim pomaga preživeti v obdobjih pomanjkanja hrane.