Zlati marmoset je omejen na majhen geografski razpon v brazilski zvezni državi Rio de Janeiro, med rekami Itabapoana in Paraíba do Sul. Njen naravni habitat je atlantski obalni deževni gozd ("Mata Atlântica"), ki se od prihoda prvih evropskih naseljencev močno krči. Ocenjujejo, da je bilo izgubljenih skoraj 90% prvotnega obalnega gozda v zvezni državi Rio de Janeiro. Preostali fragmenti so pogosto majhni in izolirani, zaradi česar so bolj dovzetni za učinke fragmentacije habitata. Izguba habitata in razdrobljenost povzroči upad populacije zlatega marmoseta z zmanjšanjem razpoložljivosti hrane, povečanjem dovzetnosti za plenjenje in bolezni ter omejevanje razpršitve in pretoka genov med skupinami.
Lov in nezakonita trgovina
Zlati marmoset je cenjen kot hišni ljubljenček zaradi svoje majhnosti, čudovite obarvanosti in poslušne narave. To vrsto so ciljali lovci za trgovino s hišnimi ljubljenčki, še preden je bila navedena kot ogrožena. Nezakonita trgovina z zlatimi marmoseti je pomembna grožnja za vrsto, saj lahko povzroči izčrpavanje divjih populacij in otežuje naravovarstvenikom, da spremljajo in spremljajo njihovo število.
Podnebne spremembe
Pričakuje se, da bodo podnebne spremembe negativno vplivale tudi na zlati marmoset. Trenutni razpon vrste bi lahko postal neprimeren zaradi sprememb temperature in padavin, razpoložljivost prehranskih virov pa se lahko zmanjša. Razdrobljenost habitata bi lahko še poslabšala učinke podnebnih sprememb z zmanjšanjem sposobnosti vrste, da se prilagaja in premakne na ustreznejša območja.
Kombinacija teh groženj je povzročila razvrstitev zlatega marmoseta, ki jo je IUCN kritično ogrozil. Za zaščito preostalih populacij te vrste si prizadevajo za ohranjanje, vključno z ustvarjanjem zaščitenih območij, obnovitvijo habitatov in ukrepi za zmanjšanje lova in nezakonite trgovine.