Sesalci:
* Malteški stenski kuščar: To je najpogosteje videti plazilca na Malti in je endemičen za otok.
* Malteški jež: Čeprav je bila predstavljena v sedemdesetih letih prejšnjega stoletja, je od takrat postala dobro uveljavljena na otokih.
* Netopirji: Na Malti je nekaj vrst netopirjev, vključno s palico podkev in mediteransko pipistrelle.
Ptice:
* Malteška strižna voda: To je morska ptica, ki se razmnožuje na malteških otokih in je zaščitena vrsta.
* The Rock Sparrow: Navadna ptica, ki jo najdemo na malteških otokih.
* Yelkouan Shearwater: Ta ogrožena ptica se vzreja na malteških otokih in je ključna osredotočenost na prizadevanja za ohranjanje.
* Peregrine sokol: Ta ptica plenilca najdemo na Malti, čeprav je njegovo število omejeno.
Druge živali:
* različne vrste rib: Okoliško mediteransko morje je dom raznolike palete ribjih vrst.
* Žuželke: Malteški otoki so dom najrazličnejših vrst žuželk, vključno z metulji, moli in hrošči.
Uvedene vrste:
* Mačke: Domače mačke so bile uvedene na Malto in so zdaj pogost prizor.
* Psi: Podobno kot mačke so tudi psi pripeljali na Malto ljudi in jih zdaj najdemo po vsej otokih.
Omeniti velja, da je Malta otoška država, zato je njena domača favna v primerjavi s celinskimi državami omejena. Na otoke močno vplivajo ljudje, kar vodi v uvedbo različnih živalskih vrst sčasoma.