Aseksualna reprodukcija:Številni enocelični organizmi se razmnožujejo aseksualno, kar pomeni, da proizvajajo potomce genetsko enake sebi. V takih primerih postane koncept interbeediranja in izmenjave genetskega materiala med različnimi posamezniki nepomemben.
Pomanjkanje jasnih meja:enocelični organizmi pogosto obstajajo kot populacije, kjer lahko posamezniki izmenjujejo genetski material z različnimi mehanizmi, kot so konjugacija, transformacija ali transdukcija. Ti procesi se lahko pojavijo med gensko raznolikimi posamezniki, zaradi česar je težko razmejiti različne meje vrst, ki temeljijo izključno na medsebojnem času.
Vodoravni prenos genov:vodoravni prenos genov je pogost pojav med enoceličnimi organizmi, kjer se lahko geni prenesejo med oddaljeno povezane vrste. To lahko povzroči pridobitev novih lastnosti in genetske raznolikosti, kar še dodatno zaplete opredelitev vrst, ki temeljijo na medvedi.
Hitra evolucija:enocelični organizmi imajo pogosto kratke generacije in visoke stopnje mutacij, kar vodi do hitrega evolucije. To pomeni, da se populacije lahko genetsko hitro razlikujejo, zaradi česar se med časom medsebojno povežejo medsebojno povezani posamezniki.
Poleg tega je koncept vrst človeški konstrukt, ki se uporablja za kategorizacijo in razumevanje raznolikosti življenja. Medtem ko je medsebojno kriterij za opredelitev vrst v mnogih primerih, je njegova uporaba za enocelične organizme lahko problematična zaradi njihovih edinstvenih značilnosti in reproduktivnih strategij. Namesto tega se raziskovalci pogosto zanašajo na kombinacijo genetskih, fenotipskih in ekoloških podatkov, da bi razmejili meje vrst med enoceličnimi organizmi.