Vendar pa obstaja nekaj stvari, ki jim lahko grozijo:
* večje plenilske ptice: Medtem ko ne bodo aktivno lovili fregate, bi lahko velike ptice, kot so orli ali jastrebi, potencialno plenile na piščance ali oslabljene posameznike.
* Ljudje: Človeška dejavnost, vključno z izgubo habitata, onesnaževanjem in ribolovnimi pribitki, lahko predstavlja grožnjo populaciji fregate.
* Paraziti: Na fregate lahko vplivajo različni zajedavci, kot so pršice, uši in črevesni črvi.
* Nevihte in vreme: Ekstremni vremenski dogodki lahko privedejo do poškodb ali smrti.
Na splošno so fregatebirdi zelo dobro prilagojeni v svoje okolje in imajo malo naravnih plenilcev. Njihove glavne grožnje izvirajo iz človeške dejavnosti in občasnega oportunističnega plenilca.