Vendar pa obstaja nekaj živali, ki lahko ogrozijo plešaste orle, zlasti mladim orlom ali tistim, ki so poškodovani ali oslabljeni:
* Večji sesalci: Medvedi, volkovi in velike mačke, kot so Cougars, bi lahko plenile mlade ali ranljive orle.
* Drugi raptorji: Zlati orli so edini znani raptor, ki redno pleni na plešastih orlih.
* Ljudje: Čeprav ni naravni plenilec, so človeške dejavnosti, kot so izguba habitata, onesnaževanje in lov (v preteklosti), negativno vplivale na populacije plešastih orlov.
Pomembno je opozoriti, da so te interakcije razmeroma redke, plešasti orli pa na splošno ne veljajo za plenske živali. Verjetno je verjetno, da bodo plenilci sami, s prehrano, ki jo sestavljajo ribe, majhne sesalce in druge ptice.