Muhe se pogosto prehranjujejo z razpadajočimi snovmi in odpadnimi proizvodi, ki jih lahko izpostavijo številnim mikroorganizmom, ki povzročajo bolezen. Ko muhe pristanejo na hrani ali drugih površinah, lahko te mikroorganizme prenesejo s svojo slino ali blatom. Uživanje teh onesnaženih muh ali njihovih izločkov ogroža posameznike, ki jim grozi prebavne bolezni in okužbe.
Poleg tega lahko nekatere leteče vrste nabirajo strupene snovi v svojih telesih, kot so težke kovine ali pesticidi, kar lahko predstavlja zdravstvena tveganja, če jih zaužijemo.
Zato na splošno ni priporočljivo namerno jesti muh, razen če prihajajo iz nadzorovanega vira ali so bile posebej pripravljene za prehrano ljudi. Če obstaja kulturna ali tradicionalna praksa uživanja določenih vrst muhe, je pomembno, da temeljito raziskujete in se posvetujete z zanesljivimi viri, da se zagotovite varnost in pravilno ravnanje, preden jih zaužijete.